【学术报告】Building Platinum Standard Reference Genome Sequences for Comparative Genomics（为比较基因组学构建白金标准参考基因组）

题   目：Building Platinum Standard Reference Genome Sequences for Comparative Genomics

报 告 人：张建伟 博士

报告时间：4月21日14：30-16：00

报告地点：新楼(原植保楼)4054

联 系 人：华金平教授 Tel-62734748

报告人简介：

张建伟 博士，美国亚利桑那大学亚利桑那基因组学研究所研究助理教授，华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室特聘研究员。2006年毕业于华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室生化与分子生物专业（生物信息学方向），获理学博士，从事生物信息学和基因组学研究逾15年。

研究方向：

通过建立水稻EST数据库（REDB）和水稻突变体数据库（RMD），开展大批量生物学数据管理与分析。在亚利桑那大学，参加多个基因组测序项目，开发出系列分析软件，服务于玉米基因组测序项目（MGSP）、稻属基因组进化项目（OGE）、国际稻属图谱比对项目（IOMAP）等，获得了高质量基因组信息资源，多途径系统解析重要生物学难题。

主要成就：

研究成果以第一或通讯作者在《The Plant Journal》、《Nucleic Acids Research》、《PLoS Genetics》、《Bioinformatics》、《PNAS》、《Molecular Plant》等期刊发表。

现担任《BMC Genomics》、《BMC Bioinformatics》副编辑（Associate Editor），《Bioinformatics》、《Theoretical and Applied Genetics》、《Molecular Genetics and Genomics》等期刊审稿人。

代表性作品：

Song J-M, Lei Y, Shu C-C, Ding Y, Xing F, Liu H, Wang J, Xie W, Zhang J, Chen L-L: Rice Information GateWay: A Comprehensive Bioinformatics Platform for Indica Rice Genomes. Molecular Plant 2018, 11(3):505-507.

Zhang J, Kudrna D, Mu T, Li W, Copetti D, Yu Y, Goicoechea JL, Lei Y, Wing RA: Genome puzzle master (GPM): an integrated pipeline for building and editing pseudomolecules from fragmented sequences. Bioinformatics 2016, 32(20):3058-3064.

Zhang J, Chen L-L, Xing F, Kudrna DA, Yao W, Copetti D, Mu T, Li W, Song J-M, Xie W et al: Extensive sequence divergence between the reference genomes of two elite indica rice varieties Zhenshan 97 and Minghui 63. Proceedings of the National Academy of Sciences 2016, 113(35):E5163.

Zhang J, Chen L-L, Sun S, Kudrna D, Copetti D, Li W, Mu T, Jiao W-B, Xing F, Lee S et al: Building two indica rice reference genomes with PacBio long-read and Illumina paired-end sequencing data. Scientific Data 2016, 3:160076.